mmcm Package

mmcm Package (CRAN)
最大対比法と修正最大対比法 (modified maximum contrast method) を実装した R パッケージです。

アップデート情報

2018/02/26 1.2-7 CRANのポリシー変更に対する対応。
2016/01/15 1.2-6 CRANのポリシー変更に対する対応。
2014/09/10 1.2-5 CRANのポリシー変更に対する対応。
2013/01/20 1.2-4 CRANのポリシー変更に対する対応。
2012/09/03 1.2-3 CRANのポリシー変更に対する対応。
2011/09/13 1.2-2 文献情報 (Nagashima, Sato, Hamada. SAGMB 2011) の追加と、ヘルプファイルの修正 (roxygen2 対応) を行いました。
2011/05/16 1.2-1 マルチコアCPUに関連したバグの修正。
2011/05/16 1.2-0 リサンプリングの計算を Open MP を用いて並列化しました。
2009/12/22 1.1-1 軽微なバグの修正、リサンプリング版修正最大対比法を絶対誤差の表示オプションの追加。
2009/12/22 1.1-0 最大対比法 (Yoshimura, 1997 などを参照) の実装と、修正最大対比法の計算精度・速度向上バージョンを実装しました。
2009/05/08 1.0-1 64 bitマシンでエラーが出ていましたので修正しました。RからのInternal関数への引数と返り値がlong型で定義されていた事が原因でした。32 bitマシンではエラーが生じないため気づきませんでした。
2009/04/18 1.0-0 公開版をCRANにリリース (Sato, Laird, Nagashima, et al. (2009) のリサンプリング版修正最大対比法を実装しました)。

Nagashima K, Sato Y, Hamada C. A modified maximum contrast method for unequal sample sizes in pharmacogenomic studies. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology 2011;10(1):Article 41. [Web Site] [PDF] [Software]
Sato Y, Laird NM, Nagashima K, Kato R, Hamano T, Yafune A, Kaniwa N, Saito Y, Sugiyama E, Kim S-R, Furuse J, Ishii H, Ueno H, Okusaka T, Saijo N, Sawada J-i, Yoshida T. A new statistical screening approach for finding pharmacokinetics-related genes in genome-wide studies. The Pharmacogenomics Journal 2009;9(2):137–146. [Web Site]
Yoshimura I, Wakana A, Hamada C. A performance comparison of maximum contrast methods to detect dose dependency. Drug Information Journal 1997;31(2):423–432. [Web Site]