単群の生存関数の検定のサンプルサイズ設計 (年次生存割合から計算)

略説

Kaplan–Meier 推定量に基づく単群の生存関数の検定について生存関数の極限分布に指数分布を想定した漸近分散に基づいて、サンプルサイズ設計を行う Web アプリです、JavaScript で作成しています。

設定する年次生存割合、登録期間、および追跡期間は全て月または年に揃えて入力してください (月で入力した場合と年で入力した場合は結果が少し異なることがあります)。
年次生存割合の年度には、何年生存割合を用いるかを入力します (初期値の例では 12 ヶ月 (1 年) 生存割合)。

現状では、Kaplan–Meier 推定量をベースにした単群の生存関数の検定のサンプルサイズ設計については決定的な文献がないと思われます (現在論文投稿準備中です)。
Kaplan–Meier 推定量をベースにした単群の生存関数の検定のサンプルサイズ設計については決定的な文献がなかったため、論文化しました (Nagashima et al., 2020)。本アプリは Fleming & Harrington (1991) の Example 6.3.1 を参考に実装しています。
理論的な背景については、Fleming & Harrington (1991) および Andersen, Borgan, Gill & Keiding (1993) をご参照ください。
無変換と対数変換は第一種の過誤の確率を制御できないほど小標本下での正規近似が悪いため、推奨できません (Bie et al., 1987; Borgan & Liestøl, 1990)。
本アプリのサンプルサイズ計算式は SWOG の One Sample Nonparametric Survival と異なるものを用います。 SWOG の One Sample Nonparametric Survival は対数変換に基づいており、これと同じ結果を出すオプションもサポートしています。なお、研究結果から本アプリでは逆正弦平方根変換をデフォルトとしています。特に理由がない場合は、逆正弦平方根変換かそれよりも保守的な二重対数変換を使った方法によるサンプルサイズ設計を推奨します。解析時は、逆正弦平方根変換を用いるか、それよりも保守的な二重対数変換を用いると良いでしょう。

アプリ

入力

年次生存割合の時点

閾値年次生存割合

期待年次生存割合

登録期間

追跡期間

$\alpha$

$1 - \beta$

仮説

変換

計算結果

計算条件

参考文献

Fleming TR, Harrington DP. Counting Processes and Survival Analysis. New York: Wiley, 1991, 236–237, Example 6.3.1.
Andersen PK, Borgan Ø, Gill RD, Keiding N. Statistical Models Based on Counting Processes. New York: Springer-Verlag, 1993, 176–287, Section IV.1–3.
Bie O, Borgan Ø, Liestøl K. Confidence intervals and confidence bands for the cumulative hazard rate function and their small sample properties. Scandinavian Journal of Statistics 1987; 14(3): 221–233.
Borgan Ø, Liestøl K. A note on confidence intervals and bands for the survival function based on transformations. Scandinavian Journal of Statistics 1990; 17(1): 35–41.
Nagashima K, Noma H, Sato Y, Gosho M. Sample size calculations for single-arm survival studies using transformations of the Kaplan–Meier estimator. Pharmaceutical Statistics 2020. In press. DOI: 10.1002/pst.2090. [arXiv:2012.03355]

履歴

2020/12/22 変換選択のセレクトボックスの説明文を修正しました
2020/12/08 論文の情報を追加しました
2018/10/11 論文投稿準備のため、修正しました
2016/03/21 テストバージョンを公開しました

To cite this page

Nagashima K, Noma H, Sato Y, Gosho M. Sample size calculations for single-arm survival studies using transformations of the Kaplan–Meier estimator. Pharmaceutical Statistics 2021;20(3):499–511. DOI: 10.1002/pst.2090. [arXiv:2012.03355]
Nagashima K. A sample size determination tool for one sample non-parametric tests for a survival proportion [Internet]. 2016 Mar 21 [cited 20XX YYY ZZ]; Available from: https://nshi.jp/en/js/onesurvyr/.